一、后防线的隐患，埃尔格拉与萨姆埃尔虽然正面防守能力出色，但两人的跑动速度偏慢，无法有效互补，边后卫卡洛斯和萨尔加多虽善于助攻，但在防守时却显得不够稳健，这导致小贝等人需要频繁补位。
二、马克莱莱的离去对皇马后场防守造成重大打击，他的离开后的替代者格拉维森虽风格英朗，但在防守端的表现却无法与马克莱莱相提并论，小贝客串后腰虽有所表现，但这一问题仍未得到解决。
三、皇马阵容的调和问题，老佛爷的超级明星阵容虽然星光熠熠，但阵容的搭配显然存在问题，尽管引进了大罗、欧文等进攻强将，但中后场的薄弱使得球队整体表现不稳定，一旦进攻受阻，球队便陷入困境，因为后场防守的薄弱，使得皇马在比赛中输球变得容易。
四、实用型球员的流失，麦克马纳曼、莫伦特斯、康西卡奥等人的离队，使得皇马在替补席上也缺乏合格的球员，当主力球员出现疲惫或伤病时，球队缺乏合适的替代者。
五、年轻球员未能担纲主力，帕文等年轻球员虽有一定实力，却未能获得主力位置，长时间依赖明星球员最终可能导致阵容失调，这也是皇马当时面临的重要问题。
皇马在领袖人物方面也存在缺失，老队长耶罗离开后，劳尔虽努力带动球队，但未能形成真正的核心形象，当时的圣卡西尚显稚嫩，无法承担起领袖的重任，即便如今有拉莫斯这样的球员，皇马依然需要在团队精神和领导力方面做出更多的努力，这一切因素共同导致了皇马银河战舰一代在欧冠赛场上的失利。
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