那不勒斯历史上在欧冠中的表现一直不俗。自1934年首次参加以来，他们从未缺席过任何一届比赛，且多次获得冠军和亚军。最近一次夺得欧冠冠军是在2020/21赛季。不过需要注意的是，那不勒斯曾经因经济问题导致球队状态波动较大，最近几年他们在欧冠中的表现明显有所改善。
那不勒斯足球俱乐部共取得了四次欧冠十六强的成绩，首次出现在拉玛西亚黄金时代的时期（1978年），他们在小组赛中以4分之一决赛的身份战胜了西甲的瓦伦西亚，但在点球大战中惜败于西班牙球队皇家马德里，第二次出现在1985年的欧冠淘汰赛中，那不勒斯在小组赛中遭遇了英超的切尔西，虽然他们在比赛中表现不佳，但最终还是通过点球大战挺进八强，接着在半决赛中面对意甲的尤文图斯，以0:3落败。
那不勒斯足球俱乐部第三次出现在1992年和1997年的欧冠八强中，分别在面对英格兰的热刺和英格兰的曼联时失败，但他们曾在1997年的四分之一决赛中战胜了这两支球队，晋级到了半决赛，而他们在半决赛中，再次在点球大战中战胜了曼联，成功杀入决赛。
那不勒斯足球俱乐部在2012年和2018年都曾因为在小组赛中被淘汰而遗憾未能再次闯入欧冠决赛，不过他们在2012年对阵利物浦的小组赛中以0:3落败，而在2018年对阵巴黎圣日耳曼的小组赛中以2:4落败，也是前队友们无法忘记的比赛之一。
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